Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CltbQ6IRU5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms