Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtprdQ64487 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PtprdQ64487 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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PtprdQ64487 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms