Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift52Q62559 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift52Q62559 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift52Q62559 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift52Q62559 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ift52Q62559 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ift52Q62559 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift52Q62559 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms