Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rbbp7Q60973 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rbbp7Q60973 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms