Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms