Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynrgQ5SV85 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms