Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdh1bQ5F204 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms