Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms