Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc110Q3V125 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms