Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc185Q3V118 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccdc185Q3V118 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccdc185Q3V118 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc185Q3V118 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc185Q3V118 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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