Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Zmat1Q3V0C1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zmat1Q3V0C1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zmat1Q3V0C1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Zmat1Q3V0C1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat1Q3V0C1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms