Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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