Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm5460Q3UQ97 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5460Q3UQ97 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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