Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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