Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Nkx6-3Q3UHX8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms