Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mier3Q3UHF3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms