Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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