Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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