Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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