Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdnep1Q3TP92 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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