Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp39Q3TIX9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp39Q3TIX9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp39Q3TIX9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Usp39Q3TIX9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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