Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms