Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms