Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms