Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Rpusd2Q149F1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpusd2Q149F1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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