Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms