Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vps8Q0P5W1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms