Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fbln1Q08879 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbln1Q08879 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms