Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

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Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Kcnma1Q08460 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Kcnma1Q08460 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnma1Q08460 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms