Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cdx4Q07424 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms