Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1sQ02789 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms