Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ascl1Q02067 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ascl1Q02067 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms