Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms