Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apoa1Q00623 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms