Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gabpb2P81069 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabpb2P81069 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms