Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Irx1P81068 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Irx1P81068 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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