Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rad50P70388 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms