Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SeboxP70368 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SeboxP70368 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SeboxP70368 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms