Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rps3P62908 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps3P62908 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms