Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vsnl1P62761 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms