Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snrpd1P62315 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snrpd1P62315 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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