Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps5P59438 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps5P59438 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms