Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpm2P58774 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms