Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Paxbp1P58501 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Paxbp1P58501 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms