Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp1P58466 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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