Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samsn1P57725 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samsn1P57725 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms