Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CartptP56388 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CartptP56388 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CartptP56388 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CartptP56388 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms