Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rrp1P56183 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp1P56183 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms