Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnnt2P50752 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnt2P50752 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms