Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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